Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn12Q9ET43 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms