Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc17Q9ESX4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc17Q9ESX4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc17Q9ESX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc17Q9ESX4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc17Q9ESX4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms