Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Rb1cc1Q9ESK9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms