Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ush1cQ9ES64 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms