Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SelenofQ9ERR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenofQ9ERR7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms