Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc28a3Q9ERH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms