Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr61Q9ERF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wdr61Q9ERF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms