Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhojQ9ER71 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms