Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms