Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms