Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r54Q9EPB8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r54Q9EPB8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms