Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpr88Q9EPB7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr88Q9EPB7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms