Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnft1Q9DCN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms