Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tomm20Q9DCC8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tomm20Q9DCC8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms