Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrotQ9DC50 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrotQ9DC50 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms