Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syde1Q9DBZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde1Q9DBZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms