Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf6Q9DBU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf6Q9DBU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms