Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms