Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg9Q9DB90 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Smg9Q9DB90 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg9Q9DB90 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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