Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med27Q9DB40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med27Q9DB40 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms