Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop5Q9DB28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms