Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp5oQ9DB20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp5oQ9DB20 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp5oQ9DB20 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms