Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm2aQ9DAR1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm2aQ9DAR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms