Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms