Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms