Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhc1Q9D9T8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms