Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D9D9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D9D9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D9D9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D9D9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D9D9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9D9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9D9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9D9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9D9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9D9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms