Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc70Q9D9B0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc70Q9D9B0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms