Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo2Q9D8S4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms