Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc91Q9D8L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc91Q9D8L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc91Q9D8L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms