Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms