Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fip1l1Q9D824 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fip1l1Q9D824 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms