Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn9Q9D805 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms