Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa5Q9D7I0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa5Q9D7I0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa5Q9D7I0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms