Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4cQ9D7F7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms