Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D7E4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D7E4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms