Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf225Q9D7D1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms