Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf13Q9D777 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13Q9D777 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13Q9D777 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13Q9D777 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13Q9D777 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13Q9D777 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms