Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tube1Q9D6T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms