Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calml3Q9D6P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calml3Q9D6P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms