Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul5Q9D5V5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul5Q9D5V5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms