Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PudpQ9D5U5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PudpQ9D5U5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PudpQ9D5U5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms