Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ShpkQ9D5J6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ShpkQ9D5J6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms