Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930449I24RikQ9D5E3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms