Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7Q9D541 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms