Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam227bQ9D518 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam227bQ9D518 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms