Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc130Q9D516 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms