Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc83Q9D4V3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms