Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcc1Q9D4H2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms