Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp4Q9D4F8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms